本书介绍了群体药动学和药效学的基础概念和理论,以业内的“金标准”软件NONMEM为例,详细介绍了群体药动学和药效学分析的方法和过程。包括数据的编辑和探索性分析、基础模型的建立、协变量的筛选、模型优化和评价、以及应用建立的模型进行模拟和给药方案的制定等。本书的最后一个章节中,应用具体案例,生动阐述了数据分析的整个过程,以期使读者更好地理解相关理论。
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目录Contents
序 1
序 2
前言
第1章 概论 1
第一节 发展史和定义 1
一、发展史 1
二、定义 2
第二节 研究内容和应用 2
一、研究内容 2
二、应用 3
第2章 基本原理 8
第一节 基本原理 8
一、个体模型和群体模型 8
二、非线性混合效应模型 9
第二节 估算方法 13
一、参数法 14
二、非参数法 14
三、贝叶斯法 14
第3章 NONMEM软件概览及数据文件 16
第一节 NONMEM软件概览 16
一、软件的发展史 16
二、软件的组成 16
第二节 数据文件 17
一、排列规则 17
二、常用变量 19
三、其他数据项 23
四、典型案例 24
五、质量控制 27
第4章 控制文件 30
第一节 简介 30
第二节 控制文件的组成 30
一、$PROBLEM模块 31
二、$DATA模块 32
三、$INPUT模块 33
四、$SUBROUTINES模块 34
五、$PK模块 36
六、$ERROR模块 41
七、$PRED模块 43
八、$THETA、$OMEGA和$SIGMA模块 44
九、$ESTIMATION和$COVARIANCE模块 50
十、$TABLE和$SCATTERPLOT模块 54
第三节 输出结果 56
一、控制文件和软件授权信息 56
二、NMTRAN 58
三、PREDPP 61
四、估算方法 63
五、中间运算结果 64
六、最终模型的参数估算值 67
七、方差和协方差 68
八、附加文件 73
第5章 模型的建立 74
第一节 分析计划和探索性数据分析 74
一、分析计划 74
二、探索性数据分析 75
第二节 基础模型 80
一、结构模型 80
二、随机效应模型 81
三、参数的估算精度 83
第三节 协变量模型 84
一、协变量的定义 84
二、图解法 85
三、统计学检验原理 87
四、常用函数表达式 88
五、逐步法 92
第四节 建模的质量控制和常见错误 95
一、质量控制 95
二、常见错误和解决方法 96
第6章 模型的评价 102
第一节 简介 102
一、内部评价和外部评价 103
二、基于模型预测和基于模型模拟的评价 103
第二节 常用评价方法 104
一、诊断图 104
二、预测误差检验 112
三、自举法 114
四、可视化预测检验 116
五、数值预测检验 120
六、正态化预测分布误差检验 122
七、后验预测检验 123
八、敏感性分析 124
第7章 自定义模型 127
第一节 简介 127
第二节 常用模块 128
一、$PRED 128
二、PREDPP子程序 128
第三节 典型示例 132
一、多元线性回归 132
二、零级和一级的混合吸收 133
三、母药和代谢物 137
第8章 药动学药效学模型 140
第一节 简介 140
第二节 常用的药动学药效学模型 141
一、直接效应模型 141
二、效应室模型 144
三、翻转模型 147
第三节 药动学药效学模型的其他考虑 150
一、药动学参数的输出 151
二、模块的选择 153
三、药动学药效学模型的拟合顺序 153
第9章 模拟 155
第一节 简介 155
一、原理 155
二、模拟计划 155
第二节 模拟 155
一、协变量分布模型 156
二、输入输出模型 157
三、试验执行模型 163
四、数据分析与解读 163
五、注意事项 165
第10章 案例 168
第一节 万古霉素 168
一、研究背景 168
二、试验设计 169
三、数据探索性分析 169
四、基础模型 171
五、协变量模型 173
六、最终模型和模型评价 175
七、模型应用 178
第二节 华法林 183
一、研究背景 183
二、试验设计 184
三、数据探索性分析 184
四、基础模型 187
五、协变量模型 192
六、最终模型和模型评价 192
七、讨论 199
第三节 丙戊酸 199
一、研究背景 199
二、试验设计 200
三、试验人群及给药方案 200
四、群体药动学模型及其控制文件 202
五、模拟数据集 203
六、模拟结果 204
七、剂量推荐 208
附录 210
附录1 分析计划书示例 210
附录2 群体药动学研究报告的大纲示例 212
附录3 群体药动学研究论文的撰写和示例 216
附录4 NONMEM常见错误提示及解决方案 219
附录5 NONMEM的标准药动学模型和参数定义 221
附录6 NONMEM的ADVAN模块参数转换关系 223
附录7 群体研究数据管理的基本要求 225
附录8 NONMEM的常用辅助工具 227
附录9 定量药理学资源网站介绍 241
附录10 中英文对照词表 245
索引 251
索引1 中文术语索引 251
索引2 英文术语索引 254