《原核微生物资源和分类学词典》并非微生物拉丁文的简单翻译，从拉丁文直译出发，中文微生物名的词源，全面标准化中文微生物名，首次建立起适用于中文文字特点及微生物的菌名系统，是对独立于拉丁文菌名之外的首次标准化尝试，首次真正让微生物走人寻常巷陌。
　　《原核微生物资源和分类学词典》可作为微生物学、地质微生物学、微生物地质学、生态学、生物学、环境学等相关领域的学生、教师、科研工作者的参考用书。

　　中文对生物的命名往往诗意有加，严谨性稍逊。从葛洪发现的葛仙米（念珠藻）即可见一斑。始于列文虎克的现代微生物研究已约350年，国际上始于1980年的唯一性命名也近40年，但中国迄今未有统一规范的微生物命名。而今微生物的新属种鉴定分析早已今非昔比，一日千里地快速发展。与此相对的，中国学者对于微生物的命名明显不足了，即使近年来中国学者在微生物资源挖掘和鉴定中，已跃居世界前列，但是命名的属种却存在较多不规范和问题，甚或无中文名，这对于师生教学或公民地位十分微妙，亦可能违反《中华人民共和国教育法》（1995）和《中华人民共和国国家通用语言文字法》（2000）。
　　中文微生物命名，离不开借鉴拉丁文命名。240多年前林奈（Linne或Linnzeus或Linnaeus，其姓氏在植物学中，简写为“L.”）制定的植物拉丁文双名法，同样在微生物命名中延续。这种延续很有意思，因为当今世界交流语言中，拉丁文基本被废除，拉丁文已是一种濒临消亡语种，而这种双名法却在动植物和微生物中依然顽强地存在并不断演化。我们分析认为，严谨性和简洁性都很重要，更重要的却是其唯一性原则，即一一对应，单菌种都有唯一的体现其基本物性的名字，比人类命名自己的姓名还要严格的规则。而让这种陌生的语言被现代人理解，释义已是必要件。
　　本书在原核生物的中文命名中，力求唯一性、延续性和简洁性，逐步实现全面科学性。从实践来看，要对译好已有拉丁文菌名，建立属于中国的微生物命名分类体系，并能被外界所理解和掌握，几乎需要同时涉及掌握微生物语言、微生物生境和源属性、人名和机构名、化学、生物学、地理学和地质学等基本要求，不亚于编辑一部小型的百科全书。
　　原计划完成一本，随着大家的重视，此书最后一分为二，一为《原核微生物资源和分类学词典》，一为《原核微生物资源和分类学》（待版）。
　　本书的排列中仍然以拉丁文的字母顺序排列。基本上以对译为主，绝大部分遵守名从其主的原则。所谓对译，而不是翻译，是因为强调中文和拉丁文之间的双向互动（一些拉丁文也是源自中文），而非仅仅是一种被动的接受。本词典对中文微生物菌名，首次给出中文词源，加粗显示，也是为了强调不仅是翻译，实际上更是建立一种中文微生物命名的标准。中文菌名除了标点，字词之间没有分割符，不给出词源，将产生很多的歧义，也不容易标准化，尝试建立中文微生物命名标准，这也是本书的一项原创。

A部
Ab
勿生营菌属（Abiotrophia）
Ac
甲壳杆菌属（Acanthopleuribacter）
甲壳杆菌科（Acanthopleuribacteraceae）
甲壳杆菌目（Acanthopleuribacterales）
螨伴菌属（Acaricomes）
醋厌氧小杆菌属（Acetanaerobaeterium）
产醋菌属（Acetatifactor）
醋肠菌属（Acetitomaculum）
醋弧菌属（Acetivibrio）
醋厌氧菌属（Acetoanaerobium）
醋杆菌属（Acetobacter）
醋杆菌属（醋杆菌亚属）[Acetobacter（subgen．Acetobacter）]
醋杆菌属（葡糖酸杆菌亚属）[Acetobacter（subgen．Gluconoacetobacter）]
醋杆菌科（Acetobacteraceae）
醋杆菌族（Acetobactereae）
醋小杆菌属（Acetobacterium）
醋杆状菌属（Acetobacteroides）
醋丝菌属（Acetofilamentum）
醋生菌属（Acetogenium）
醋卤菌属（Acetohalobium）
醋微菌属（Acetomicrobium）
醋线体属（Acetonema）
醋热菌属（Acetothermus）
勿胆原体属（Acholeplasma）
勿胆原体科（Acholeplasmataceae）
勿胆原体目（Acholeplasmatales）
勿色菌科（Achromatiaceae）
勿色菌属（Achromatium）
勿色杆菌属（Achromobacter）
胺酸杆菌属（Acidaminobacter）
胺酸果菌科（Acidaminococcaceae）
胺酸果菌属（Acidaminococcus）
酸双面菌属（Acidianus）
酸烫菌属（Acidicaldus）
酸胶囊菌属（Acidicapsa）
酸铁杆菌属（Acidiferrobacter）
酸叶菌科（Acidilobaceae）
酸叶菌目（Acidilobales）
酸叶菌属（Acidilobus）
酸微菌科（Acidimicrobiaceae）
酸微菌目（Acidimicrobiales）
酸微菌亚纲（Acidimicrobidae）
酸微菌纲（Acidimicrobiia）
酸微菌属（Acidimicrobium）
嗜酸菌属（Acidiphilium）
酸原体属（Acidiplasma）
酸体属（Acidisoma）
酸球菌属（Acidisphaera）
酸土单胞菌属（Aciditerrimonas）
酸磂竿菌科（Acidithiobacillaceae）
酸磂竿菌目（Acidithiobacillales）
酸磂竿菌纲（Acidithiobacillia）
酸磂竿菌属（Acidithiobacillus）
酸杆菌纲（Acidobacteria）
酸小杆菌科（Acidobacteriaceae）
酸小杆菌目（Acidobacteriales）
酸小杆菌属（Acidobacterium）
酸胞菌属（Acidocella）
酸单胞菌属（Acidomonas）
酸热菌科（Acidothermaceae）
酸热菌目（Acidothermales）
酸热菌属（Acidothermus）
吞酸菌属（Acidovorax）
不运杆菌属（Acinetobacter）
端果孢菌属（Acrocarpospora）
海边杆菌属（Actibacter）
海边小杆菌属（Actibacterium）
放线金孢菌属（Actinaurispora）
放线异墙菌属（Actinoallomurus）
放线异垒菌属（Actinoalloteichus）
放线竿菌属（Actinobacillus）
……

B部
C部
D部
E部
F部
G部
H部
I部
J部
K部
L部
M部
N部
O部
P部
Q部
R部
S部
T部
U部
V部
W部
X部
Y部
Z部