本书目次编排按照西医疾病系统为纲目，主要包括：呼吸系统疾病、循环系统疾病、消化系统疾病、泌尿系统疾病、血液系统疾病、内分泌与代谢疾病、风湿性疾病、感染性疾病以及神经系统疾病，并收入目前已有中医类指南与专家共识的所有疾病。