《新刊药性要略大全》十一卷，卷一总论，总述诸品药性阴阳论、用药阴阳法象、手足三阴三阳明训图、药性升降浮沉补泻法、引诸经报使歌诀、泻诸经火邪用药例、散诸经寒邪用药例、洽诸经头痛要药、孕妇忌用诸药、药有十八反、药有十九畏、药性赋等。卷二至卷十各论，共收录药物706味，分为草木花卉部、金石贝壤部、人部、虫豸禽兽部分述各药。卷十一附太医院经验捷效单方156首。本次整理以日本龙谷大学图书馆收藏的明代嘉靖二十四年（1545）明德堂刻本为底本。

新刊药性要略大全卷之一
诸品药性阴阳论
用药阴阳法象
古人服药有法
手足三阴三阳明训图
手足阴阳表里引经主治例
药性升降浮沉补泻法
东垣引经
引诸经报使歌诀
泻诸经火邪用药例
散诸经寒邪用药例
治诸经头痛要药
随症用药凡例
攻克血积癥瘕诸药
攻克诸积药例
孕妇忌用诸药
药有十八反
药有十九畏
药性赋寒热温平四章

新刊药性要略大全卷之二
草木花卉部
人参
黄芪
甘草
山药
白扁豆
芡实
茯苓
茯神
白术
苍术
沙参
玄参
苦参
贝母
知母
黄柏
黄连
胡黄连
黄芩
黄栀
丹参
紫参
天门冬
麦门冬
生地黄
熟地黄
当归
川芎
抚芎
芎劳
白芷
藁本
细辛
杜蘅
白芍药
赤芍药
桔梗
乌药

新刊药性要略大全卷之三
厚朴
陈皮
青皮
枳壳
枳实
半夏
南星
蒟蒻
前胡
柴胡
银柴胡
葛根
升麻
麻黄
桂
筒桂
肉桂
桂心
桂花
紫苏
苏子
玄胡索
葫芦巴
补骨脂
骨碎补
狗脊
菟丝子
胡麻子
大麻子
苘麻子
白油麻
覆盆子
金樱子
肉苁蓉
锁阳
牛膝
杜仲
诃子
黑附子
侧子
天雄
川乌
白附子
白薇
白蔹
白及
续断
石斛
远志
益智
缩砂仁
白豆蔻
草豆蔻
草果
肉果
香附子

新刊药性要略大全卷之四
红豆
良姜
生姜
干姜
川椒
秦椒
胡椒
荜拨
荜澄茄
吴茱萸
山茱萸
葱白
葱子
大蒜
韭子
胡荽
萝卜
山楂
使君子
木瓜
甜瓜蒂
王瓜
王瓜根
王瓜子
瓜蒌子
天花粉
地骨皮
枸杞子
五味子
莺粟
莺粟壳
薏苡仁
何首乌
石莲子
莲子
莲花、莲须
莲叶、莲房
藕
藕节汁
蒲黄
菖蒲
艾叶
薄荷
荆芥穗
香薷
神曲
麦芽
大麦
小麦
浮小麦
荞麦
粳米
陈米
粟米
黍米
糯米
谷芽
饴糖
酒
醋
淡豆豉
赤小豆
绿豆粉
黑大豆
山豆根
威灵仙
防风
连翘
羌活
独活
天麻
定风草
赤箭
萆薜
菝葜
山牛
桑寄生
枫寄生
淫羊藿
大枫子
牛蒡子
苍耳子
苍耳草
佛耳草

新刊药性要略大全卷之五
益母草
茺蔚子
蔓荆子
决明子
蓖麻子
白蒺藜
木贼草
密蒙花
旋覆花
甘菊花
菊花
白菊花
款冬花
金银花
过冬藤
钓藤
青藤
寻风藤
甘露藤
石楠叶
茵芋叶
芙蓉叶
尤美叶
海桐皮
榆皮
秦皮
白鲜皮
白杨皮
紫荆皮
牡荆子
紫荆木
牡丹皮
五加皮
桑白皮
桑汁
杏仁
桃仁
桃枭
桃胶
郁李仁
柏子仁
红花
苏木
干漆
京三棱
草三棱
蓬莪术
阿魏
郁金
姜黄
莲药
大黄
巴豆
皂荚
雷丸
大腹子
大腹皮
槟榔
牵牛
商陆
秦艽
防己
木通
通草
灯心草
猪苓
泽泻
瞿麦
篇蓄
车前子
茵陈
昆布
海藻
甘遂
芫花
荛花
大戟
巴戟
……

新刊药性要略大全卷之六
新刊药性要略大全卷之七
新刊药性要略大全卷之八
新刊药性要略大全卷之九
新刊药性要略大全卷之十
太医院经验捷效单方卷之十一
校注后记