《世医通变要法》分上、下两卷，共211条目。上卷又分为卷之上和卷上二，自始至《蛊毒一百》终，共列100种病证，主论内伤杂病，兼论六经病及皮肤病；下卷又分为卷下和卷下后，自《肿胀总论》始，至《异病二百》终。共列111种病证，主论外科、耳鼻喉科、儿科和妇科杂病，兼论部分内伤杂病。
　　本次整理，以明嘉靖己亥年（1539）刊本为底本。

卷之上
中风第一
中寒第二
中暑第三
中湿第四
燥病第五
火病第六
痛风第七
鼓槌风第八
历节风第九
伤寒总论
太阳第十
阳明十一
少阳十二
太阴十三
少阴十四
厥阴十五
大头肿十六
瘟疫十七
疟疾十八
下痢十九
呕吐二十
泄泻二十一
霍乱二十二
发痧二十三
腹痛二十四
咳嗽二十五
咯血二十六
声哑二十七
伤风二十八
感冒二十九
痰涎三十
饮水病三十一
注夏三十二
拂郁三十三
哮病三十四
喘急三十五
诸气三十六
脾胃病三十七
翻胃三十八
五噎三十九
五膈四十
……

卷上二
卷下
卷下后
校注后记