本书第1章“混菌发酵与微生物生态学”介绍了可控微生物菌群构建技术与微生物生态学的关系，主要从理论层面讨论可控混菌体系构建策略和技术创新；第2章～第5章，分别从食品酿造、能源开发、饲料加工和生物基化学品合成应用研究方面展开，论述了可控微生物混菌体系在上述行业领域的应用与创新。

第1章 混菌发酵与微生物生态学
1.1 混菌发酵和微生物生态学的发展历程
1.2 混菌发酵过程中微生物生态学的研究内容
1.3 现代微生物生态学研究理论
1.4 微生物生态学的传统研究方法
1.5 微生物生态学的分子生物学方法
1.6 微生物生态学的组学方法最新进展概况
参考文献
第2章 混菌发酵技术在食品领域中的应用与创新
2.1 发酵酒制品
2.2 发酵肉制品
2.3 发酵板栗食品
参考文献
第3章 混菌发酵技术在能源开发中的应用与创新
3.1 微生物群落预处理玉米秸秆
3.2 沼气发酵
3.3 生物制氢
参考文献
第4章 混菌发酵技术在动物饲料中的应用与创新
4.1 发酵豆粕
4.2 发酵麸皮
参考文献
第5章 混菌发酵技术在生物基化学品中的应用与创新
5.1 菌藻混合培养生产生物油脂和色素
参考文献