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具有噪声和时滞的基因调控网络动力学分析 读者对象:动力学分析人员
本书利用分岔分析和能量面的方法探讨了三个基因调控系统的全局动力学和稳定性,其中两个与肿瘤抑制蛋白p53有关的调控系统和一个耦合正反馈回路。首先,DNA损伤会激活p53信号通路,使得p53表现出不同的动力学,进而调控不同的细胞命运,比如细胞周期阻滞和细胞调亡等。p53信号通路中的核心是p53-Mdm2模块Mdm2抑制p53的表达,而研究表明PDCD5通过调控Mdm2而激活p53的表达,因此,针对一个PDCD5调控p53-Mdm2系统,探讨了Mdm2的生成和降解速率对p53动力学和稳定性的影响。其次,基于此模型,2016年诸葛等人进一步考虑了在Ser-395位点磷酸化的Mdm2和变化的ATM表达而扩展了原来的模型,针对这个新模型我们讨论了p53的产生率和PDCD5的表达水平对p53动力学和稳定性的影响。最后,针对一个从生物系统中抽象出来的耦合正反馈回路,在其中增加了两个分子间的正反馈构造了新的模型,针对新的模型,探讨了分子间反馈强度和噪声引起双稳态切换的动力学,并用能量面解释了稳态切换的原理。
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