《同治上江两县志》是上元、江宁两县的合志，它参考此前诸志结合自身所处的时代环境而有所创新。卷前的天章部分辑录多次南巡并驻跸南京的康熙、乾隆二帝题咏南京的诗文匾联。卷一圣泽记主要记载清代历朝皇帝有关南京之诏告政令及相关大事，尤其详于康乾二帝南巡之事。卷二大事记可谓一篇简要的南京编年史。卷三以下十卷，皆以“考”命名，包括山、水、城厢、田赋、食货、学校、兵、祠祀、建置、艺文等十个专题。卷十三以下八卷，皆以“谱”命名，包括秩官、科贡、列女、古今人、古迹、咸丰三年以来兵事、忠义、贞烈等八个专题。卷二十一以下六卷，皆以“录”命名，包括名宦、乡贤、忠义孝悌、耆旧、方技、方外等六个专题。最后两卷是图说和摭佚。该志在辑存文献、排比史料、考辨异说、订正讹误等方面，都有不少贡献，其体例安排与结构设计，亦自具特色。