加强对柑橘溃疡病的防控研究是柑橘产业发展的迫切需求。为了突破优质候选基因不多、功能和分子机制研究不深等制约柑橘抗溃疡病分子育种的瓶颈，作者及所在团队长期致力于挖掘柑橘抗、感溃疡病相关基因研究。本著作介绍了作者长期以来围绕柑橘抗、感溃疡病基因的一系列原创研究成果，是作者所在团队主导的多个科研项目的凝练和总结，主要涉及柑橘抗、感溃疡病相关基因的挖掘、功能验证以及机理解析等方面的研究。
本书适用于植物分子生物学、植物病理学等领域从事教学和科研的师生学者及研究人员和技术人员作为参考书使用。

李强
·西南大学副教授、研究生导师
·法国国家科学研究中心(CNRS)和法国图卢兹大学(UPS)博士
·法国国立植物基因组资源中心(CNRGV)访问学者
·数据库RedOxiBase和CitGVD的创建者。在西南大学致力于柑橘抗病分子育种和全基因组选择育种研究。在国内外期刊发表研究论文60余篇，授权专利30余项，担任20余家杂志的评审专家。

第一篇 绪论
第一章 柑橘与柑橘溃疡病 002
第一节 柑橘概述 002
一、柑橘 002
二、柑橘的用途 002
第二节 柑橘产业发展现状与面临的问题 003
一、柑橘产业发展现状 003
二、柑橘产业面临的问题 004
第三节 柑橘溃疡病及其危害 004
一、柑橘溃疡病 004
二、柑橘溃疡病的危害 004
第四节 柑橘溃疡病菌的侵染与传播 005
一、柑橘溃疡病菌的侵染 005
二、柑橘溃疡病的传播 005

第二章 柑橘溃疡病的防治 007
第一节 综合防治策略 007
一、控制传染源 007
二、切断远距离传播途径 008
三、培育抗病新品种 008
第二节 抗、感病基因资源及应用 009
一、非柑橘源抗病相关基因及应用 009
二、柑橘源抗病相关基因及应用 010

第三章 柑橘抗病分子育种的技术体系和研究方法 012
第一节 基因转化体系 012
一、表达载体 012
二、柑橘遗传转化和鉴定 012
三、柑橘瞬时转化 013
四、病毒介导的基因沉默 014
第二节 柑橘溃疡病抗性评价体系 015
一、针刺法 015
二、注射法 015
三、柑橘溃疡病菌生长曲线 015
第三节 分子生物学方法 016
一、蛋白质与蛋白质互作 016
二、蛋白质与DNA 互作 016
第四节 生物信息学和统计学方法 017
一、主要的生物信息学方法 017
二、统计学方法 018


第二篇 转录调控因子
第四章 CsAP2-09 在柑橘溃疡病中的功能 020
第一节 AP2/ERF 转录因子的研究背景 020
一、AP2/ERF 转录因子的结构与分类 020
二、AP2/ERF 转录因子的功能 021
第二节 柑橘AP2 家族分析 021
一、柑橘AP2 家族的鉴定 021
二、柑橘AP2 家族保守结构域和系统发育分析 022
三、柑橘AP2 家族受溃疡病诱导的表达模式 022
第三节 CsAP2-09 的生物信息学和表达分析 024
一、CsAP2-09 的生物信息学特征 024
二、CsAP2-09 受外源激素诱导表达 026
三、CsAP2-09 的亚细胞定位和转录激活活性 026
第四节 CsAP2-09 正调控柑橘溃疡病抗性 027
第五节 CsAP2-09 调控柑橘溃疡病抗性的分子机制 029
一、CsAP2-09 过表达植株的转录组分析 029
二、CsAP2-09 调控水杨酸和茉莉酸的合成 031
三、CsAP2-09 调控过氧化物酶和超氧化物歧化酶活性 031
四、CsAP2-09 调控柑橘活性氧水平 032
五、CsAP2-09 调控柑橘溃疡病菌侵染的超敏反应 034
六、CsAP2-09 调控植物细胞木质素化 034
七、CsAP2-09 与多个抗病相关蛋白互作 035
第六节 本章小结 036

第五章 CsBZIP40 在柑橘溃疡病中的功能 038
第一节 BZIP 转录因子的研究背景 038
第二节 柑橘BZIP 家族分析 039
一、柑橘BZIP 家族 039
二、柑橘BZIP 家族染色体定位和基因复制 041
三、柑橘BZIP 家族的信息学特征 041
第三节 CsBZIP40 的表达分析 043
一、CsBZIP40 的亚细胞定位 043
二、CsBZIP40 受溃疡病的诱导表达模式 044
三、CsBZIP40 受外源激素的诱导表达模式 044
第四节 CsBZIP40 正调控柑橘溃疡病抗性 045
一、CsBZIP40 过表达增强柑橘溃疡病抗性 045
二、CsBZIP40 的干扰表达可增强柑橘溃疡病易感性 045
第五节 CsBZIP40 调控柑橘溃疡病抗性的机制 047
一、CsBZIP40 与CsNPR1 互作并调控水杨酸合成 047
二、CsBZIP40 调控水杨酸响应基因 047
三、CsBZIP40 调控活性氧平衡 049
第六节 本章小结 050

第六章 CsWRKY43 在柑橘溃疡病中的功能 052
第一节 WRKY 转录因子的研究背景 052
一、WRKY 转录因子的结构 052
二、WRKY 转录因子的功能 052
三、WRKY 转录因子的调控机制 053
第二节 CsWRKY43 的生物信息学特征 053
第三节 CsWRKY43 的表达特征 054
一、CsWRKY43 的亚细胞定位 054
二、CsWRKY43 受溃疡病的诱导表达模式 055
第四节 CsWRKY43 负调控柑橘溃疡病抗性 056
第五节 CsWRKY43 负调控柑橘溃疡病抗性的机制 057
一、CsWRKY43 调控过氧化物酶酶活性 057
二、CsWRKY43 靶向并激活CsPRX53 057
第六节 本章小结 059

第七章 CsWRKY61 在柑橘溃疡病中的功能 061
第一节 CsWRKY61 的生物信息学特征 061
第二节 CsWRKY61 的表达特征 062
一、CsWRKY61 的亚细胞定位 062
二、CsWRKY61 受溃疡病的诱导表达模式 062
第三节 CsWRKY61 正调控柑橘溃疡病抗性 063
第四节 CsWRKY61 调控柑橘溃疡病抗性的机制 064
第五节 本章小结 065

第八章 CitMYB20 在柑橘溃疡病中的功能 066
第一节 MYB 转录因子的研究背景 066
第二节 CitMYB20 的表达特征 066
一、CitMYB20 受溃疡病的诱导表达模式 066
二、CitMYB20 受激素的诱导表达模式 067
第三节 CitMYB20 正调控柑橘溃疡病抗性 068
一、CitMYB20 转基因植株鉴定 068
二、CitMYB20 转基因植株抗性评价 068
第四节 本章小结 070

第九章 CiNPR4 在柑橘溃疡病中的功能 072
第一节 病程相关基因非表达子的研究背景 072
第二节 CiNPR4 正调控柑橘溃疡病抗性 072
第三节 CiNPR4 正调控柑橘溃疡病抗性的机制 074
一、CiNPR4 调控水杨酸和茉莉酸合成 074
二、CiNPR4 调控水杨酸和茉莉酸响应基因 074
三、CiNPR4 与CsTGA2 互作 075
第四节 本章小结 076


第三篇 植物免疫受体
第十章 CsWAKL08 在柑橘抗溃疡病中的功能 079
第一节 细胞壁关联的类受体激酶的研究背景 079
一、细胞壁关联的类受体激酶的发现 079
二、细胞壁关联的类受体激酶的结构和分类 080
三、细胞壁关联的类受体激酶的功能和机制 080
第二节 柑橘WAKL 家族分析 081
一、柑橘WAKL 家族的鉴定 081
二、柑橘WAKL 家族的系统发育 082
三、柑橘WAKL 家族的结构域 083
第三节 柑橘WAKL 家族受溃疡病的诱导表达模式 084
第四节 CsWAKL08 的信息学和表达特征 085
一、CsWAKL08 的信息学特征 085
二、CsWAKL08 受水杨酸和茉莉酸诱导表达模式 086
三、CsWAKL08 定位于质膜 087
第五节 CsWAKL08 正调控柑橘溃疡病抗性 087
一、CsWAKL08 过表达增强柑橘溃疡病抗性 087
二、CsWAKL08 干扰增强柑橘溃疡病易感性 089
第六节 CsWAKL08 正调控柑橘溃疡病抗性的机制 090
一、CsWAKL08 调控活性氧平衡 090
二、CsWAKL08 调控茉莉酸的生物合成 091
三、CsWAKL08 调控茉莉酸响应基因 091
第七节 本章小结 092

第十一章 CsLYK6 在柑橘溃疡病中的功能 093
第一节 溶解素基序类受体激酶的研究背景 093
一、溶解素基序类受体激酶的发现 093
二、溶解素基序类受体激酶的功能和机制 093
第二节 柑橘LYK 家族分析 095
一、柑橘LYK 家族的鉴定 095
二、柑橘LYK 家族的系统发育 095
第三节 CsLYK6 的生物信息学特征 096
第四节 CsLYK6 的表达特征 097
一、CsLYK6 受柑橘溃疡病的诱导表达模式 097
二、CsLYK6 的亚细胞定位 097
第五节 CsLYK6 正调控柑橘溃疡病抗性 098
第六节 CsLYK6 正调控柑橘溃疡病抗性的机制 099
一、CsLYK6 调控过氧化氢合成 099
二、CsLYK6 调控CsRBOH5 的磷酸化和转录 100
三、CsLYK6-CsCPK13-CsMAPK6 模块调控CsRBOH5 的磷酸化 100
四、CsLYK6-CsMAPK6-CsWRKY33 模块调控CsRBOH5 的转录 101
第七节 本章小结 103

第十二章 CsNBS-LRR 在柑橘溃疡病中的功能 105
第一节 NBS-LRR 的研究背景 105
第二节 柑橘NBS-LRR 的生物信息学特征 106
第三节 柑橘CsNBS-LRR 的表达特征 106
第四节 柑橘CsNBS-LRR 正调控柑橘溃疡病抗性 107
第五节 柑橘CsNBS-LRR 正调控柑橘溃疡病抗性的机制 108
一、CsNBS-LRR 调控水杨酸和茉莉酸合成 108
二、CsNBS-LRR 调控水杨酸响应基因 108
第六节 本章小结 109


第四篇 植物ROS 平衡调控酶系统
第十三章 CsPrx25 在柑橘溃疡病中的功能 112
第一节 CⅢ过氧化物酶的研究背景 112
第二节 柑橘CⅢ Prx 家族分析 113
一、柑橘CⅢ Prx 家族的鉴定 113
二、柑橘CⅢ Prx 家族的系统发育 115
三、柑橘CⅢ Prx 家族的染色体定位 116
第三节 柑橘CⅢ Prx 家族的生物信息学特征 117
第四节 CsPrx25 的表达特征 118
一、CsPrx25 定位于质外体 118
二、CsPrx25 受溃疡病的诱导表达模式 118
第五节 CsPrx25 正调控柑橘溃疡病抗性 119
第六节 CsPrx25 正调控柑橘溃疡病抗性的机制 120
一、CsPrx25 调控酶促抗氧化系统 120
二、CsPrx25 调控活性氧平衡 120
三、CsPrx25 调控木质化 122
第七节 本章小结 122

第十四章 CsGSTU18 和CsGSTF1 在柑橘溃疡病中的功能 124
第一节 谷胱甘肽-S - 转移酶的研究背景 124
第二节 柑橘GST 家族分析 125
一、柑橘GST 家族的鉴定 125
二、柑橘GST 家族的系统发育 128
三、柑橘GST 家族的染色体定位 128
四、柑橘GST 家族的基因结构和保守基序 128
第三节 CsGSTU18 和CsGSTF1 的表达特征 130
一、CsGSTU18 和CsGSTF1 受柑橘溃疡病诱导表达模式 130
二、CsGSTU18 和CsGSTF1 受激素诱导表达模式 130
三、CsGSTU18 和CsGSTF1 的亚细胞定位 131
第四节 CsGSTU18 和CsGSTF1 在柑橘溃疡病中的功能 132
一、CsGSTU18 和CsGSTF1 瞬时转化降低ROS 水平 132
二、CsGSTU18 和CsGSTF1 的沉默增强溃疡病抗性 132
第五节 CsGSTU18 和CsGSTF1 调控柑橘溃疡病抗性的机制 133
第六节 本章小结 134


第五篇 植物细胞壁代谢相关酶
第十五章 CsXTH04 在柑橘溃疡病中的功能 136
第一节 木葡聚糖内转葡萄糖基/ 水解酶的研究背景 136
第二节 柑橘XTH 家族分析 136
一、柑橘XTH 家族的鉴定 136
二、柑橘XTH 家族的系统发育 138
三、柑橘XTH 家族的染色体定位与基因复制 138
第三节 柑橘XTH 家族鉴定的表达特征 141
第四节 CsXTH04 的表达特征 142
第五节 CsXTH04 负调控柑橘溃疡病抗性 142
一、CsXTH04 过表达增强柑橘溃疡病易感性 142
二、CsXTH04 干扰增强柑橘溃疡病抗性 143
第六节 本章小结 144

第十六章 CsPAE2 在柑橘溃疡病中的功能 146
第一节 果胶乙酰酯酶的研究背景 146
第二节 柑橘PAE 家族分析 147
一、柑橘PAE 家族的鉴定 147
二、柑橘PAE 家族的系统发育 148
三、柑橘PAE 家族的保守结构域和二级结构 148
四、柑橘PAE 家族的染色体定位和基因结构 148
第三节 CsPAE2 受柑橘溃疡病诱导表达模式 150
第四节 CsPAE2 负调控柑橘溃疡病抗性 151
一、CsPAE2 过表达增强溃疡病易感性 151
二、CsPAE2 沉默增强柑橘溃疡病抗性 152
第五节 本章小结 152

第十七章 CsPGIP 在柑橘溃疡病中的功能 154
第一节 多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白的研究背景 154
第二节 柑橘PGIP 的生物信息学特征 155
第三节 CsPGIP 的表达特征 156
一、CsPGIP 的亚细胞定位 156
二、CsPGIP 受柑橘溃疡病的诱导表达模式 156
第四节 CsPGIP 正调控柑橘溃疡病抗性 158
一、CsPGIP 过表达转基因植株的鉴定 158
二、CsPGIP 过表达转基因植株的表型 158
三、CsPGIP 过表达转基因植株的抗性评价 158
第五节 本章小结 160


附录 162

参考文献 178

后记 186