《交叉科学结构论（第二版）》从诠释交叉学科、交叉科学概念入手，论析了交叉学科与边缘学科、综合学科、横向学科、跨学科的联系和区别以及交叉科学与软科学的关系，探讨了交叉科学在科学知识体系中的地位，对交叉科学的次级子系统——学科门类做了初步的认定。第3章至第30章，依次概述了地理科学、海洋科学、资源科学、生态科学、环境科学、城市科学、农村科学、建筑科学、设计科学、服装科学、安全科学、警务科学、军事科学、管理科学、科学史、技术史、工程史、科学哲学、技术哲学、工程哲学、科学学、技术学、工程学、情报科学、知识科学、体育科学、人类学等28个交叉科学学科门类的发展历程和学科结构。第31章，解析了交叉学科的形态关系创生模式和内涵关系创生模式，提出交叉科学新学科创生区位的几种预测性判断方法。第32章，从交叉科学一些学科门类的不同发展历程中提炼出两翼聚合、内需外引、外入内生、预设建构等四种发展机制，阐释了制度安排、组织保障、人才培育等三项发展对策，提出创建以交叉科学作为研究对象的学科——交叉科学学的构想。