《中国-中东欧国家科技创新记分卡》开篇介绍了方法论与指标说明，并给出了报告的主要结论。随后是主体部分，共分为五章：第一章至第四章分别从科技基础设施、科学研究、技术发明和企业创新4个方面，展现中国-中东欧国家的科技创新现状、趋势和合作特征；第五章是国别概览，展示各国的科技创新特点。最后是附表，提供报告中所使用的具体数据。

引言
方法论与指标说明
主要结论

第一章 中国-中东欧国家科技基础设施
1．1 研发投入
1．2 教育和人力资源
1．3 信息通信基础设施
1．4 制度环境

第二章 中国-中东欧国家科学研究
2．1 论文产出规模
2．2 论文学术影响力
2．3 论文国际合作
2．4 论文优势学科

第三章 中国-中东欧国家技术发明
3．1 专利产出规模
3．2 专利国际化
3．3 专利影响力
3．4 专利优势技术领域

第四章 中国-中东欧国家企业创新
4．1 创新活动规模
4．2 合作创新状况
4．3 创新经费支出
4．4 创新成果的知识产权保护
4．5 创新的阻碍因素

第五章 国别概览
阿尔巴尼亚
波黑
保加利亚
中国
克罗地亚
捷克
爱沙尼亚
希腊
匈牙利
拉脱维亚
立陶宛
黑山
北马其顿
波兰
罗马尼亚
塞尔维亚
斯洛伐克
斯洛文尼亚
附表